matu portada2 Dr. Ricardo Matute Morales

El Dr. Matute recibió su de Bioquímico de la Universidad de Chile en el año 2005. En el año 2011, recibió su grado de Doctor en Química de la Universidad de  Chile. Ha realizado diversas estadía postdoctorales en reconocidos centros tales como: University of California, Los Angeles (2011), University of Southern California (2013), Caltech (2016 y 2017). Actualmente se desempeña como Académico e Investigador del CIBQA.


Línea de Investigación

  • Se investiga la naturaleza de las reacciones químicas en diversos sistemas de interés en base a marcos teóricos de química cuántica que permitan describir apropiadamente los procesos electrónicos involucrados en la ruptura y formación de enlaces covalentes. Se utilizan tanto métodos cuánticos ab initio como métodos basados en la Teoría del Funcional de la Densidad para caracterizar las energías y estructuras asociadas a los intermediarios y los estados de transición que participan en diversos mecanismos de reacción. Mi línea de investigación considera además el estudio de la catálisis enzimática por medio de modelos multiescala, de tipo híbrido QM/MM, y en particular el desarrollo e implementación del método EVB (Empirical Valence Bond).

     

    matu portada

Proyectos

4. FONDECYT REGULAR 1181260, Investigador Responsable. Universidad Patrocinante: UBO. “Development of an Empirical Valence Bond Model for the Computer-Aided Design of Photon-Activated Enzyme Catalysts”

3. FONDECYT REGULAR 1180348, Co-Investigador. Universidad Patrocinante: UNAB. “The E=E[N, υ(r)] density functional theory representation as a basis for the development and exploration of chemical reactivity models along bond-breaking/bond-forming processes”

2. FONDECYT REGULAR 1181754, Co-Investigador. Universidad Patrocinante: UNAB. “Developments and exploration of chemical reactivity and bonding within the Bonding Evolution Theory (BET) as a suitable framework for understanding the mechanism of chemical reactions”

1. NSF / XSEDE Allocation Grant MCB170140, Co-Investigador. Universidad Patrocinante: Caltech. “Exploring the rotation of the gamma shaft of F1-ATPase in single-molecule experiments

Publicaciones

15. Matute, R. A.*; Pérez, P.; Chamorro, E.; Villegas-Escobar, N.; Cortés-Arriagada, D.; Herrera, B.; Gutiérrez-Oliva, S.; Toro-Labbé, A.*: “Reaction Electronic Flux Perspective on the Mechanism of the Zimmerman Di-π-methane Rearrangement”. Org. Chem. 2018, 83, 5969–5974. [Article featured on the Journal Front Cover

14. Matute, R. A.; Yoon, H.; Warshel, A.*: “Exploring the mechanism of DNA polymerases by analyzing the effect of mutations of active site acidic groups in Polymerase β”. Proteins 2016, 84, 1644–1657. [Article featured on the Journal Back Cover

13. Mavri, J.*; Matute, R. A.; Chu, Z. T.; Vianello, R.: “Path Integral Simulation of the H/D Kinetic Isotope Effect in Monoamine Oxidase B Catalyzed Decomposition of Dopamine”. Phys. Chem. B 2016, 120, 3488–3492.

12. Morales-Bayuelo, A.*, Matute, R. A., and Caballero, J.: “Understanding the Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) in terms of Molecular Quantum Similarity and DFT-based Reactivity Descriptors”. Mol. Model. 2015, 21, 156.

11. Matute, R. A.; Garcia-Garibay, M. A.*; Houk, K. N.*: “Theory of Substituent Effects on the Regioselectivity of Di-π-Methane Rearrangements of Dibenzobarrelenes”. Org. Lett. 2014, 16, 5232-5234.

10. Jiménez-Oses, G.; Liu, P.; Matute, R. A.; Houk, K. N.*: “Competition Between Concerted and Stepwise Dynamics in the Triplet Di-π-Methane Rearrangement”. Chem. Int. Ed. 2014, 53, 8664–8667.

9. Yang, Y.; Linke, M.; von Haimberger, T.; Matute, R.; González, L.; Schmieder, P.; Heyne, K.*: “Active and silent chromophore isoforms for phytochrome Pr photoisomerization: An alternative evolutionary strategy to optimize photoreaction quantum yields”. Struct. Dyn. 2014, 1, 014701.

8. Martín García, F.; Matute, R. A.: “Premio Nobel a la Química Teórica en Superordenadores” (“Nobel Prize to the Theoretical Chemistry on Supercomputers” (In Spanish)) Revista Española de Física 2013, 27(4), 9-11. [Invited Article for the Spanish Royal Society of Physics]

7. Matute, R. A.; Houk, K. N.*: “The Triplet Surface of the Zimmerman Di-π-methane Rearrangement of Dibenzobarrelene”. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 13097-13100. [Article featured on the Journal Inside Back Cover]

6. Yang, Y.; Linke, M.; von Haimberger, T.; Hahn, J.; Matute, R.; González, L.; Schmieder, P.; Heyne, K.*: “Real-time tracking of phytochrome’s orientational changes during Pr photoisomerization”. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 1408-1411.

5. Neculqueo, G.; Rojas Fuentes, V.; López, A.; Matute, R.; Vasquéz, S. O.*; Martínez, F.*: “Electronic properties of thienylene vinylene oligomers: synthesis and theoretical study”. Struct. Chem. 2012, 23, 1751-1760.

4. Dietzek, B.*; Fey, S.; Matute, R. A.; González, L.; Schmitt, M.; Popp, J.; Yartsev, A.; Hermann, G.: “Wavelength-dependent photoproduct formation of phycocyanobilin in solution – Indications for competing reaction pathways”. Chem. Phys. Lett. 2011, 515, 163-169.

3. Matute, R. A.*; Contreras, R.; González, L.*: “Time Dependent DFT on Phytochrome Chromophores: A Way to the Right Conformer”. Phys. Chem. Lett. 2010, 1, 796-801.

2. Matute, R. A.; Contreras, R.; Pérez-Hernández, G.; González, L.*: “The Chromophore Structure of the Cyanobacterial Phytochrome Cph1 As Predicted by Time-Dependent Density Functional Theory”. Phys. Chem. B 2008, 112, 16253-16256.

1. Cuitiño, L.; Matute, R.; Retamal, C.; Bu, G.; Inestrosa, N. C.; Marzolo, M. P.*: “ApoER2 is endocytosed by a clathrin-mediated process involving the adaptor protein Dab2 independent of its Rafts’ association”. Traffic 2005, 6, 820-838.

Translate »